いろいろやってみましたが、PC起動後、Aptanaのみ起動し、エミュレータを起動すると保存できるみたいです。 いままで、Outlook、Chrome、Word、Excel、Delphi等いろいろ作業しながら、jsWaffleも作業するスタイルだったのがまずかったようです。 ただ、どれが影響するのか、あるいは、メモリーが足らないのか原因は不明です。 ありがとうございました。