基本的なことですが、Androidアプリとしてコンパイルしない限り、 jsWaffleのカメラメソッドなど利用できないようになっています。 以下の手順に沿って、作業されていますか? http://d.aoikujira.com/jsWaffle/wiki/index.php?%E3%83%97%E3%83%AD%E3%82%B8%E3%82%A7%E3%82%AF%E3%83%88%E3%81%AE%E5%A7%8B%E3%82%81%E6%96%B9