ありがとうございます。
早速、Eclipseをインストールしてみました。
これを使うのは初めてなので、そもそもの導入方法が間違っているのかもしれませんが、
jsWaffle で Eclipse の workspace に "MyTest01" をつくった後で
Eclipseで New Android App のウィザードで
Create Project in Workspace のチェックを入れると
There is already a file or directory named "MyTest01" in the selected location.
Create Project in Workspace のチェックを外すと
Folder 'C:\eclipse\workspace\MyTest01' is not empty.
となって、プロジェクトがつくれません。
そっこはかとなく、プラグインとの相性が悪くなってしまったのかな?と感じます。
いかがでしょうか?
http://d.aoikujira.com/jsWaffle/tasukeai/attach/361-jsw.png