通常のアンドロイドプロジェクトは、もう一年以上普通に作成できております。JSWaffleだけが特定のバージョンのプロジェクトでエラーとなってしまう現象です。 動作しているJSWaffleプロジェクトのビルドターゲットを変更するだけで、動かなくなりますので、JSWaffleがバージョン指向性が強いのかなあと思います。