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お返事遅れました。
実機で動かないとのことですが、DDMSでエラーメッセージを見て、
何か、エラーが表示されていませんでしょうか？
＞あと、jsWaffleで作ると、create project from existing source から作ることになると思うんですけど、これで作る場合は全部、バージョンを1.6以上にするとThe API level for the selected SDK target does not match the Min SDK Version. が表示されて、android manifest.xmlから直すしかないんですか？
そうです。jsWaffleは互換性を考えて作っているので、以上の作業が必要となります。将来のバージョンで改善したいと思います。
プログラマーを目指しているとのこと、いいですね。
私も文系出身のプログラマーですし、プログラマーに文系の方も多いようです。
現場では、即戦力が欲しいと思いますので、
とにかく、いろいろなアプリを作って、実績を作るといいと思います。
頑張って下さい！